بنابر موسسه تحقیقات بازار IHS، قطعات آیفون SE در نسخه 16 گیگابایتی، 160 دلار است. معمولا زمانیکه آیفونی جدید به بازار می‌آید، IHS آن را تکه‌تکه می‌کند تا بتواند قیمت قطعات آن را تخمین بزند. IHS تخمین می‌زند که قیمت قطعات این آیفون، 156.2 دلار است که اگر هزینه ساخت را نیز به آن اضافه کنیم، می‌توان آن را به 160 گرد کرد. اینطور بنظر می‌رسد که اپل برای پایین آوردن هزینه ساخت این آیفون، از تعدادی از قطعات آیفون 6، 6s و 5s استفاده کرده است.
به عنوان مثال، نمایشگر گوریلا گلس یکی از گران‌ترین قطعات است که 20 دلار قیمت دارد. زمانی که این نمایشگر در آیفون 5s مورد استفاده قرار می‌گرفت، چیزی حدود دو برابر قیمت داشت. زمانی که آیفون 5s رونمایی شد، قیمت قطعات آن 199 دلار تخمین زده شد. برای پرچمدار جدید اپل، آیفون 6s پلاس، قیمت قطعات 236 دلار است.
برای آیفون SE نسخه 64 گیگابایتی، IHS تخمین می‌زند که سود اپل به دلیل ارزان بودن حافظه، 89 دلار بیشتر باشد. وین لم، تحلیلگر ارشد موبایل و شبکه IHS می‌گوید:
اپل مایل است که قیمت‌های خود را کاهش دهد تا فروش را افزایش دهد. اگر چه الان روی مشتریانی حساب باز کرده است که مایل به آپگرید به SE نسخه 64 گیگابایتی هستند. زمانی که ماشین سود اپل در مقابل نیروی یک بازار در حال بلوغ تسلیم می‌شود، به طور ضمنی اعتراف خود به ایمن نبودن در برابر کسادی جهانی بازار گوشی‌های هوشمند را نشان می‌دهد.
البته باید در نظر داشت که تخمین‌های موسسه IHS هزینه‌های دیگر مانند تحقیق و توسعه، بازاریابی، نرم‌افزار و توزیع را در نظر نمی‌گیرد. پس هرچند هم این آمار جالب باشد، نباید از آن برای تخمین سود اپل استفاده کرد. CNN نیز قبلا در گزارشی قیمت قطعات آیفون SE را 220 دلار تخمین زده بود، اما IHS تجربه بیشتری در تخمین قیمت قطعات دارد.
در گذشته، تیم کوک، مدیر عامل اپل، گفته است که تمام این تخمین‌ها نادرست است. او می‌گوید:
تخمین‌های زیادی درباره محصولات ما دیده شده است که با واقعیت هم‌خوانی ندارد. من تا به‌حال هیچ تخمین دقیقی ندیده‌ام.
